您當前位置: 首頁  >  新聞中心  >  伟德新聞  >  正文

伟德新聞

計算機科學與技術專家講座系列報道(許東)

發布日期:2021-05-17 發布人: 點擊量:

    202157日上午,許東教授應伟德国际BETVlCTOR邀請,以線上形式做了題為“Deep-learning Protein Localization Prediction with Residue-level Interpretation”的學術講座。



許東老師是美國密蘇裡大學電子工程和計算機科學系的Paul K Shumaker講座教授,同時擔任Christopher S. Bond生命科學中心研究員和信息技術專業主任。許東教授在北京大學獲得本科與碩士學位,于1995年在伊利諾伊大學獲得博士學位。他在美國國家癌症研究所做了兩年博後工作,此後在橡樹嶺國家實驗室做了六年研究工作,一直到2003年加入密蘇裡大學,從2007-2016年,他擔任該校計算機科學系的系主任。許東教授的研究主要集中在生物信息學方面,包括機器學習在生物信息學的應用,蛋白質結構預測,蛋白質定位預測,蛋白質翻譯後修飾的識别,單細胞數據的分析,還有植物、微生物和癌症的計算機模拟研究,以及生物信息系統。他的蛋白結構預測工作獲得2001 R&D 100大獎。許東教授目前已發表400多篇論文,他是美國科學促進會(AAAS2015年)會士和美國醫學和生物工程研究院(AIMBE2020年)會士。




講座中,許東教授首先對蛋白質定位預測任務進行了簡單的介紹,然後詳細介紹了論文中提出的基于深度學習的定位預測框架MULocDeep,該框架可以預測蛋白質在亞細胞和亞組織水平的多個定位,接下來介紹了MULocDeep中使用的注意力機制,通過引入注意力機制,不但提高了實驗的準确率而且還增強了模型的可解釋性。之後介紹了MULocDeep在不同數據集下跟其他模型的比較結果。許東教授還在線演示了MULocDeep Server的使用。


     



最後,許東教授悉心回答了老師和同學們的問題。超過130位同學和老師參加了本次報告,本次活動受到了我院師生的一緻好評。








Baidu
sogou