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計算機科學與技術專家講座系列報道 (許東)

發布日期:2022-12-15 發布人: 點擊量:

20221211日和1212日,美國密蘇裡大學哥倫比亞分校信息學研究所許東教授應伟德国际BETVlCTOR邀請,以線上騰訊會議的形式為伟德国际BETVlCTOR的老師和同學們作了題為“Deep Graph Models”的學術報告。


講座開始後,許東教授首先介紹了什麼是圖,然後介紹了為什麼要使用圖神經網絡。圖的編碼可以分為淺編碼和深編碼,首先介紹淺編碼。節點間的相似性可以定義為餘弦相似度,用原圖中兩節點的關系和embedding後兩節點的餘弦相似度的差異作為損失函數,以此來評估embedding的效果。可以使用随機遊走來将圖中的各個節點串聯成一條路徑,并将該路徑視為一句話,并用NLP方法對其中節點進行編碼,如Word2Vec。随機遊走方式包括DFSBFS,并使用一個有偏向性的遊走策略以平衡局部和全局信息。


但是淺編碼包括一系列問題,如O(V)的參數量,不能為沒見過的節點編碼,且不能加入節點信息,深編碼應運而生。如效仿CNNGCN,先将圖用傅裡葉變換轉換到譜域再用逆傅裡葉變換轉換到空域,聚合節點本身和其鄰居節點的信息傳遞到下一層。GraphSAGEGCN類似,相比于GCN的直接把鄰居節點和本身的信息相加,GraphSAGE随機聚合一部分節點的信息并進行聚合(如平均、PoolingLSTM)。Graph Attention Network可以對于不同的節點設置不同的Attention值,将聚集改為将各個節點特征加權後相加。對于多頭注意力機制,則将多個聚集後的結果concat連接後作為最終結果。之後講解了Graph BertGraph Transformer等一系列延伸模型,介紹了邊分類、節點分類、圖分類、鍊接預測、異常檢測等下遊任務的實現方法。


講座結束後,許東教授熱情地與同學們展開互動,并根據同學和老師們的問題提供了詳盡的解答。本次報告收到了廣大師生的熱烈響應,引發了強烈反響。

許東教授是電氣工程與計算機科學系特聘教授,任教于克裡斯托弗·邦德生命科學中心和美國密蘇裡大學哥倫比亞分校信息學研究所。許東老師于2007-2016年擔任計算機科學系主任,2017-2020年擔任信息技術項目主任。于1995年博士畢業于美國伊利諾伊大學,在美國國家癌症研究所做了兩年的博士後工作。在加入密蘇裡大學之前,許東老師一直是橡樹嶺國家實驗室的科學家。30年來,許東老師在計算生物學和生物信息學的多個領域進行了研究,包括單細胞數據分析、蛋白質結構預測與建模、蛋白質翻譯後修飾、蛋白質定位預測、計算系統生物學、生物信息系統和生物信息學在人類、微生物和植物中的應用等。自2012年以來,許東老師的研究重點為生物信息學和深度學習之間的接口。許東老師現已發表了400多篇論文,被引用21,000餘次。并于2015年入選美國科學促進會研究員,2020年入選美國醫學與生物工程研究所研究員。


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