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2017級本科生蔡金蒲在計算生物學領域重要國際期刊Briefings in Bioinformatics發表論文

發布日期:2021-03-19 發布人: 點擊量:

    伟德国际BETVlCTOR周豐豐教授等人的論文“A comprehensive comparison of residue-level methylation levels with the regression-based gene-level methylation estimations by ReGear”被計算生物學領域重要國際期刊Briefing in bioinformaticsCCF-B類期刊)錄用。論文第一作者為周豐豐教授指導的軟件學院2017級本科生蔡金蒲,通訊作者為周豐豐教授,其他作者包括黃岚教授等。

DNA甲基化是在不改變DNA序列的前提下影響基因功能的生物學過程。DNA甲基化機制通常将甲基附着在某些特定的胞嘧啶殘基上,從而改變染色質的結構,啟動子區域的這種修飾将使某些腫瘤抑制基因失活,編碼區内的DNA甲基化可能顯著降低轉錄延伸效率。基于此,本論文研究提出了基于回歸模型的基因層面甲基化特征構造算法,對基因和胞嘧啶的甲基化水平與樣本标簽和分類性能的相關性進行了綜合評價,同時發現使用基因甲基化水平,非監督聚類也得到了改進,為生物大數據分析提供了一種全新的研究視角。

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